一. 在进样阀后加流路过滤器（0.5μm烧结的不锈钢片），挡住来源于样品和进样阀垫圈的微粒；在流路过滤器和分析柱之间加“保护柱”，可收集堵塞柱进口的来自样品的化学“垃圾”。保护柱是易耗品，实验室中应常备。

二. 色谱柱避免突然变化的高压冲击；色谱柱应在要求的PH值范围和柱温范围下使用，应使用不损坏柱的流动相；进样前应将样品进行必要的净化，以免进样后对色谱柱造成损伤。

三. 每次工作结束后，应使用溶剂冲洗色谱柱，样品成分不要残留在柱中。

四. 注意氯离子对不锈钢的腐蚀，为此最好去除流动相中氯离子。

五. 以硅胶做基质制成的色谱柱在使用缓冲液后，须用0.1%乙酸水溶液洗涤；对氰基丙基类色谱柱，不要使用高浓度的乙腈做流动相。

六. 如果色谱柱入口压力增高，或峰形异常，须清洗色谱柱，清洗后依然异常的，可取出柱入口端数毫米的固定相，或更换新的填料，以及更换新色谱柱。注意，色谱柱的清洗和取出固定相，一定要由专业技术人员操作，或在其指导下进行。